您是如何了解到中心网站的?
随着后基因组时代的到来,生命信息的挖掘及诠释已成为人类科学最关注的重大课题,生物信息学也因此成为当今生命科学的重要前沿学科,同时也将是21世纪自然科学最具活力的核心领域之一。为了紧跟这一时代的步伐,增进我校师生对生物信息学学科前沿知识和技术的理解和掌握,加强生物信息学在新药研发和三大药学人才培养方面的应用力度,很有必要建立高水平的生物信息学教学和科研平台,缘此,“广东药学院生物信息快速挖掘中心”应时而生,该中心不仅立足于我校生物信息学的教学和科研服务,还可通过互联网服务于社会。 该中心以各级生命科学信息为研究内容,基于生命科学理论和现代信息技术的原理及其算法,筛选、评估、分类、注释和集成各类现有的国际国内生物信息学数据库及应用软件,并以网页形式整合成界面友好、功能强大、操作简易、高效率和专业化的生物信息资源综合应用平台,可望实现生命科学信息的挖掘从“湿”科学到“硅”科学的转变,有助于药物研发从随机筛选到理性设计的跨越。 此外该中心会作为广东药学院生物信息学教学平台,设置的教育资源和专题研究专区,使更适应教学需求的同时,凸显我校对这门崭新学科建设的优势。
预祝本中心成功挂网到广东药学院图书馆。 本中心初建完成,将作为本校生物信息学课程的教学平台投入使用。 感谢一直为本中心的搭建默默付出的工作人员,祝愿他们顺利完成工作。
常用序列分析工具
SeWeR:Sequence analysis using WEB Resources
SMS:Sequence Manipulation Suite
BLAST
SRS
VecScreen
CpGProD
Dragon Promoter Finder
McPromoter
NNPP
Promoter 2.0
Promoter Searching - Lecture Links
TSSP-TCM
WWW Promoter Scan
启动子、转录调节区域分析
FirstEF:First Exon Finder?
NCBI ORF Finder
Tmpred
BankIt
Sequin
WEBin
DNA序列数据库
ACLAME
AluGene
Ciliate IES-MDS database
CORG:A database for COmparative Regulatory Genomics
Islander
TIGR Plant Repeat Databases
VectorDB
中国核酸序列数据库
ARTADEdb
ASAP
ASD
ASDB
EASED
Xpro
ABS
ACTIVITY
AGRIS
DBTSS
EPD
JASPAR
PLACE
PlantCARE
PlantProm DB
RegulonDB
TrSDB
GenBank
DDBJ
EMBL Nucleotide Sequence Database
DNA在线工具
Electronic PCR
FirstEF
RNA序列结构数据库
Aptamer
CORG
European rRNA database
microRNA Registry
NONCODE
Plant snoRNA Database
The RNA World Website
The tmRNA website
RNA在线工具
蛋白质序列数据库
ExPASy
MIPS
NCBI Protein database
Swiss-Prot
TrEMBL@Swiss-Prot
UniProt
Aaindex
ProTherm
DBSubLoc
NUREBASE
PSIPRED
THGS
Catalytic Site Atlas
PredictProtein
PROSITE database
CDD - Conserved Domain Database
FusionDB
Hits:A database of protein domains and motifs
HSSP
InterPro:INtegrated resource of protein sites
iProClass
Pfam
PIRSF
SMART
GPCRDB: Information system for G protein-coupled receptors
KinG
KNOTTIN
MEROPS
RPG
The Peptaibol Database
TransportDB
蛋白质序列分析工具
SeqFacts
蛋白质结构/功能预测
Andrej Sali Lab
APSSP2
CPHmodels
Jpred
SCRATCH servers
河北大学生物信息中心
3D-JIGSAW
Bakerlab
ESyPred3D
Jinbo Xu's Homepage
ModBase
Swiss-Model
AGADIR
VIPERdb
分子结构数据库
MMDB
RESID
SCOR
3D-GENOMICS
ArchDB Compilation Paper
CADB
CATH
CE Compilation Paper
DomIns
DSDBASE
E-MSD
生物磁共振数据库
FSSP
Genomic Threading Database
HOMSTRAD
IMGT/3Dstructure-DB and IMGT/
PDB
SCOP
SUPERFAMILY database
SURFACE
SWISS-MODEL
The ASTRAL Compendium
TOPS
综合数据库
INSD( 国际核酸序列数据库)
EMBL序列数据库
GenBank 序列数据库
GSDB
TIGR
BioSino
CUTG
TRANSFAC
TRRD
OOTFD
RepBase
MicroSatellite
ALU数据库
Simple Repeats
COMPEL
MPDB
HvrBase
Mendel
HOX Pro
OPD
dbSTS
dbEST
AmmtDB
HOVERGEN
DNA结构参数库
NUCLEOSOME
SELEX_DB
Intronerator
IDB和IEDB
EID
ExInt,外显子、内含子数据库
NDB
Vector和Vector-ig