|
|
| >>当前页面:专题研究 |
专题一:核酸序列分析 |
| |
 检索人瘦素 (leptin) 的mRNA、外显子和5’调控区 (promoter) 等核酸序列 |
|
|
| |
Entrez系统是NCBI的核心检索系统,管理了NCBI的主要生物信息资源,包括DNA序列数据库、蛋白质序列数据库和UniGene数据库等。Entrez根据用户的要求在各专项数据库之间进行检查检索。Entrez是面向生物学家的数据库查询系统,其特点之一是使用十分方便。它把序列、结构、文献、基因组 、系统分类等不同类型的数据库有机地结合在一起,通过超文本链接,用户可以从一个数据库直接转入另一个数据库,同时,Entrez把数据库和应用程序结合在一起。
|
| |
|
| |
 BioEdit软件进行可读框架分析 |
|
|
| |
BioEdit 是一个完全免费的序列编辑器与分析工具软件,功能非常强大,使用也很简单。可以进行序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制等。这里我们在中文手册(来自bio-soft.net)下载中附上了由福建农林大学植病所Raindy制作的汉化包,请在安装bioedit后进行汉化。
|
| |
|
| |
 人瘦素 (leptin) mRNA序列与其外显子或基因组序列的比对分析 |
|
|
| |
BLAST2,一种比对分析搜索工具,可以快速查找与给定序列具有连续相同片断的序列的技术。
|
| |
|
专题二:PCR引物设计与评价 |
| |
 PCR引物设计与评价 |
|
|
| |
| 简介:Primer premier5.0 点击下载 |
|
[关闭] |
Primer Premier5.0是由加拿大的Premier公司开发的专业用于PCR或测序引物以及杂交探针的设计和评估的软件,其主要界面分为序列编辑窗口(Genetank),引物设计窗口(Primer Design),酶切分析窗口(Restriction Sites)和Motif分析窗口。该软件主要用来进行引物设计,可以简单地通过手动拖动鼠标以扩增出相应片段所需的引物,也可以给定条件,让软件自动搜索引物,并将引物分析结果显示出来,而且进行这些操作非常简单。
Oligo是专门的引物设计软件,它的初始界面是两个图:Tm图和ΔG图;Oligo 6.0的界面更复杂,出现三个图,加了个Frq图。“Oligo”的功能比“Premier”还要单一,就是引物设计。但它的引物分析功能如此强大以至于能风靡全世界。
|
| |
|
专题三:多重序列比对及系统发生树的构建 |
| |
 多重序列比对及系统发生树的构建 |
|
|
| |
Clustal X是Clustal W的图形界面版本,在开发了Clustal W之后,Thompson et al.又再接再厉在Clustal W基础上增加了图形界面便有了Clustal X,它的操作更加直观简单,对ClustalW的操作方式不习惯的windows用户可以使用这个版本,下载后无需安装,解压缩后找到clustalx.exe打开就行。
你可以到这里下载其他操作系统的版本。
|
| |
|
专题四:蛋白质序列分析和结构预测 |
| |
人脂联素蛋白质序列的检索 |
|
|
| |
Entrez系统是NCBI的核心检索系统,管理了NCBI的主要生物信息资源,包括DNA序列数据库、蛋白质序列数据库和UniGene数据库等。Entrez根据用户的要求在各专项数据库之间进行检查检索。Entrez是面向生物学家的数据库查询系统,其特点之一是使用十分方便。它把序列、结构、文献、基因组 、系统分类等不同类型的数据库有机地结合在一起,通过超文本链接,用户可以从一个数据库直接转入另一个数据库,同时,Entrez把数据库和应用程序结合在一起。
|
| |
|
| |
使用BioEdit软件对人脂联素蛋白质序列进行分子质量、氨基酸组成和疏水性等基本性质分析 |
|
|
| |
BioEdit 是一个完全免费的序列编辑器与分析工具软件,功能非常强大,使用也很简单。可以进行序列编辑、外挂分析程序、RNA分析、寻找特征序列、支持超过20000个序列的多序列文件、基本序列处理功能、质粒图绘制等。这里我们在中文手册(来自bio-soft.net)下载中附上了由福建农林大学植病所Raindy制作的汉化包,请在安装bioedit后进行汉化。
|
| |
|
| |
人脂联素蛋白质序列的蛋白质同源性分析 |
|
|
| |
BLAST为目前生物信息学研究上极为重要的工具,特别是在资料库的搜寻,与核算或氨基酸序列相似性的比对方面,堪称目前使用最为广泛的方法。此法的演算式与统计学家出是有Altschul等人于1990年发表,并陆续改进,至1996年由美国的NCBI支持成为网络侍服工具。
|
| |
|
| |
 人脂联素蛋白质序列的motif结构分析 |
|
|
| |
主要提供对氨基酸序列的分析服务,分析预测其中可能的motif,可选择不同的motif库,选择不同的蛋白库,并可对输出文件做出不同的要求。
|
| |
|
| |
 人脂联素蛋白质序列的二级结构预测 |
|
|
| |
蛋白质结构预测服务是一个因特网服务序列分析和预测蛋白质的结构和功能. 用户可以提交蛋白质序列或排列,进行蛋白质结构的预测,并且所有服务结果,用户可通过电子信箱察看分析结果。
|
| |
|
| |
 蛋白质序列的三维结构预测 |
|
|
| |
SWISS-MODEL是一项预测蛋白质三级结构的服务,它利用同源建模的方法实现对一段未知序列的三级结构的预测。该服务创建于1993年,开创了自动建模的先河,并且它是迄今为止应用最广泛的免费服务之一。
|
| |
|
| 版权所有:生命科学与生物制药学院 生物制药研究所 |
| 地址:广州大学城*广东药学院*生命科学与生物制药学院 |
联系电话:020-39352011
Email:liushunhui@gdpu.edu.cn

|